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【重大学术突破】基准医疗“DeepMeth甲基化数据处理AI模型”论文脱颖而出,被国际顶级人工智能学术会议AAAI'22收录

2021-12-07

12月1日,基准医疗与南开大学联合共建的医学数据研究中心提交的重量级学术论文《Noninvasive Lung Cancer Early Detection via Deep Methylation Representation Learning》被人工智能促进协会AAAI(Association for the Advancement of Artificial Intelligence)下属的全球人工智能顶级学术会议,第36届AAAI'22(会议时间:2022年2月22日-3月1日,温哥华)收录。本次会议共收到9,251篇投稿,创下AAAI投稿量的历史纪录;最终接收1,349篇论文,录取率为15.0%,创历史新低。



基准医疗基于AI深度学习(Deep Learning)的DeepMeth甲基化数据处理模型是全球首个基于深度学习通过连续向量表示甲基化区域的算法,也是基准医疗肺癌早检产品PulmoSeekTM Plus的核心算法基础。此次基准医疗DeepMeth研究工作能从近万份研究论文中脱颖而出,是世界AI学术界对基准医疗在肿瘤早诊早筛领域工作的高度认可,也是精准医疗及AI+癌症交叉学科领域的一个令人振奋的消息,再加上早前PulmoSeekTM肺癌早检甲基化液体活检模型已在国际重要学术期刊《The Journal of Clinical Investigation》发表,多项国际学术权威机构的认可奠定了基准医疗在全球肺癌早检领域当之无愧的技术领先地位。


接下来将为大家揭开这项算法的神秘面纱:


01突围之路,破局ctDNA甲基化早检临床应用瓶颈



血浆样本中低丰度的循环肿瘤DNA(ctDNA)一直是癌症早检的难点。南开大学计算机学院与基准医疗的医学数据研究中心联合攻关,历经数年,首次利用深度学习连续向量表示甲基化区域的算法,强化了甲基化区域的整体性和连续性,成功开发了“深度甲基化表示学习进行无创肺癌早期检测的DeepMeth”核心技术,一举突破这个重大的学术和产业难关。


02精准锚定,探秘CpG 位点的丰富遗传学信息



不同于现有指标通常仅表示每个区域甲基化位点的频率、忽略甲基化CpG位点的定位和甲基化模式,而这些正是癌症检测的预测特征;DeepMeth独立看待每个甲基化区域并开发出自动编码器来学习隐藏在区域布局中的丰富信息(例如,甲基化 CpG 位点的位置和共甲基化区域)。这是世界上首次用连续向量表示甲基化区域的深度学习模型研究,可以很大程度上避免甲基化检测的维度灾难。


03深度验证,普及肺癌早检临床应用



DeepMeth算法模型已在全国14家医院多中心临床数据集上评估了检测性能:与基线相比,DeepMeth实现了显著的AUC提升;并可与传统的临床检查指标相结合,提高整体检测的准确度。自2020年4月以来,全国已有94家医院使用了基于DeepMeth模型的PulmoSeekTM Plus产品(用于早期肺癌检测)。

 

基准医疗始终坚持从“卫生经济学的角度”出发,本着“以患者利益为本”的初心,在技术上精耕不辍、厚积薄发,不断优化产品性能,提高性价比,将癌症早期诊断整体解决方案落到实处,最终惠及更多有需要的普通人群。


【点击文末阅读原文,了解“基准医疗携手南开大学成立医学数据研究中心”】

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关于AAAI和AAAI会议


AAAI和AAAI会议始于1979-1980年,由人工智能鼻祖、图灵奖获得者MarvinMinsky和John McCarthy等人创办。起初为美国人工智能协会,2007年改名为国际人工智能促进协会。每年一次的AAAI会议是全球人工智能领域的顶级学术会议也是中国计算机学会(CCF)指定的A类会议。AAAI在全球拥有超过6,000名成员,汇集了全球最顶尖的人工智能领域专家学者,一直是国际人工智能研究的风向标,在学术界久负盛名。AAAI Fellow被誉为“国际人工智能领域的名人堂”,包括两位最新图灵奖得主、深度学习先驱 Yoshua Bengio和Yann LeCun。

关于基准医疗


引领精准医疗,造福千家万户



基准医疗成立于2015年,是一家国际领先的采用甲基化高通量测序进行癌症早筛早诊产品开发的公司。创始人范建兵博士是基因检测领域的国际领军人物,拥有近30年从事人类基因组学、基因芯片(Microarrays)及高通量测序技术开发的经验。

基准医疗是中国首家将ctDNA甲基化高通量测序技术用于肿瘤早诊的企业,并自主构建了全球最大的中国人群癌症早期甲基化数据库。自创立以来,基准医疗一直致力于自主开发真正具备临床价值的单癌种、多癌种乃至泛癌种早筛早诊产品,产品管线覆盖了包括肺癌、乳腺癌、消化道癌症和泌尿系统癌症在内的超过70%高发癌种。此外,基准医疗还自主打造以肺癌早筛早诊和治疗为中心的大数据和人工智能平台。更多产品信息与商务合作,欢迎拨打400-930-0052垂询。